Posso usar o saldo do Mottu Entregas para pagar?

Pode. Ao assinar o contrato, você autoriza a Mottu a usar repasses do Mottu Entregas (ou de outros parceiros) pra quitar parcelas e encargos do aluguel. Funciona como uma espécie de "compensação" entre o que você tem a receber e o que tem a pagar.